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Zentrum für Technomathematik

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Dr. Jan Hendrik Kobarg

Ehemaliger Mitarbeiter der AG Technomathematik

Raum: BITZ

Projekte

  1. EU-UNLocX: Uncertainty principles versus localization properties, function systems for efficient coding schemes (01.09.2010 - 31.08.2013)

Abschlussarbeiten (Auswahl)vollständige Liste

  1. Vergleich des Einflusses der räumlichen Glättungsmethoden Chambolle und bilaterales Filtern für MALDI-Daten anhand von Segmentierungskarten (Nicolas Jathe)
  2. Blind Source Separation für MALDI-Imaging (Jens Behrmann)
  3. Wavelet-Based Baseline Correction for MALDI TOF MS (Magdalena Metzger)

Patente

  1. P. Maaß, J. H. Kobarg, F. Alexandrov, P. Vandergheynst, M. Goldabaee.
    Verfahren zum rechnergestützten Verarbeiten von räumlich aufgelösten Hyperspektraldaten, insbesondere von Massenspektrometriedaten.
    Deutsches Patent- und Markenamt DE102013207402A1,
    Anmeldenummer: 1020132074, Anmeldedatum: 24.04.2013.
    Veröffentlicht in Patenblatt Nr.: am 30.10.2014.

Publikationen (Auswahl)vollständige Liste

  1. T. Boskamp, D. Lachmund, R. Casadonte, L. Hauberg-Lotte, J. H. Kobarg, J. Kriegsmann, P. Maaß.
    Using the chemical noise background in MALDI mass spectrometry imaging for mass alignment and calibration.
    Analytical Chemistry, 92(1):1301-1308, 2020.

    DOI: 10.1021/acs.analchem.9b04473
    online unter: https://doi.org/10.1021/acs.analchem.9b04473

  2. S. Devaux, D. Cizkova, J. Quanico, J. Franck, S. Nataf, L. Pays, L. Hauberg-Lotte, P. Maaß, J. H. Kobarg, F. Kobeissy, C. Mériaux, M. Wisztorski, L. Slovinska, J. Blasko, V. Cigankova, I. Fournier, M. Salzet.
    Proteomic Analysis of the Spatio-temporal Based Molecular Kinetics of Acute Spinal Cord Injury Identifies a Time- and Segment-specific Window for Effectife Tissue Repair.
    Molecular & Cellular Proteomics, 15:2641-2670, 2016.

    DOI: 10.1074/mcp.M115.057794

  3. T. Boskamp, D. Lachmund, J. Oetjen, Y. Hernandez-Cordero, J. Behrmann, J. H. Kobarg, R. Casadonte, J. Kriegsmann, P. Maaß.
    Visualizing MALDI TOF datasets of FFPE tissue samples for the purpose of quality assessment and comparison.
    OurCon IV - 2016, 17.10.-21.10.2016, Ustron, Polen.

    online unter: http://www.bioradint.eu/ourcon_public/papersview.php?showdetail=&paper_id=45

  4. J. Oetjen, K. Veselkov, J. Watrous, J. McKenzie, M. Becker, L. Hauberg-Lotte, J. H. Kobarg, A. K. Mróz, N. Strittmatter, F. Hoffmann, D. Trede, A. Palmer, S. Schiffler, K. Steinhorst, M. Aichler, R. Goldin, O. Guntinas-Lichius, F. von Eggeling, H. Thiele, K. Mädler, A. Walch, P. Maaß, P. C. Dorrestein, Z. Takats, F. Alexandrov.
    Benchmark datasets for 3D MALDI- and DESI-imaging mass spectrometry.
    GigaScience, 4, 2015.

    DOI: 10.1186/s13742-015-0059-4

  5. J. H. Kobarg.
    Signal and image processing methods for imaging mass spectrometry data.
    Dissertationsschrift, Universität Bremen, 2014.

    online unter: http://nbn-resolving.de/urn:nbn:de:gbv:46-00104098-10