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Zentrum für Technomathematik

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Delf Lachmund

Ehemaliger Mitarbeiter der AG Technomathematik


Forschungsgebiete

Projekte

  1. BMBF-MPI²: Modellbasierte Parameteridentifikation in Magnetic Particle Imaging (01.12.2016 - 30.11.2019)
  2. Magnetic Particle Imaging (seit 01.03.2016)
  3. BMBF-MaDiPath: Massenspektrometrisches Profiling/Grading für onkologische Routineanwendungen der digitalen Pathologie (01.10.2015 - 30.09.2018)
  4. Qualitätsbewertung von MALDI-Imaging-Daten (seit 01.04.2015)
  5. Nicht-negative Matrix-Faktorisierung mit A-priori-Wissen (seit 01.12.2014)
  6. Entwicklung eines Digital-Staining-Verfahrens als pathologisch-histologisches Diagnosewerkzeug auf Basis der MALDI-Imaging-Technologie (01.07.2014 - 30.06.2016)

Veranstaltungen (Auswahl)vollständige Liste

  1. Übungen Numerik 1 (Wintersemester 2014/2015)

Abschlussarbeiten (Auswahl)vollständige Liste

  1. Klassifizierung von MALDI-Daten mit linearer Regression (Norbert Maager)
  2. Klassifikation auf MALDI-Daten mit nichtnegativer Matrixfaktorisierung und überwachtem Lernen (Maximilian Schmidt)

Publikationen (Auswahl)vollständige Liste

  1. T. Boskamp, D. Lachmund, R. Casadonte, L. Hauberg-Lotte, J. H. Kobarg, J. Kriegsmann, P. Maaß.
    Using the chemical noise background in MALDI mass spectrometry imaging for mass alignment and calibration.
    Analytical Chemistry, 92(1):1301-1308, 2020.

    DOI: 10.1021/acs.analchem.9b04473
    online unter: https://doi.org/10.1021/acs.analchem.9b04473

  2. J. Leuschner, M. Schmidt, P. Fernsel, D. Lachmund, T. Boskamp, P. Maaß.
    Supervised Non-negative Matrix Factorization Methods for MALDI Imaging Applications.
    Bioinformatics, bty909 , 2018.

    DOI: 10.1093/bioinformatics/bty909

  3. Y. Cordero Hernandez, T. Boskamp, R. Casadonte, L. Hauberg-Lotte, J. Oetjen, D. Lachmund, A. Peter, D. Trede, K. Kriegsmann, M. Kriegsmann, J. Kriegsmann, P. Maaß.
    Targeted Feature Extraction in MALDI Mass Spectrometry Imaging to Discriminate Proteomic Profiles of Breast and Ovarian Cancer.
    Proteomics - Clinical Applications, 1700168 , Wiley, 2018.

    DOI: 10.1002/prca.201700168

  4. T. Boskamp, D. Lachmund, J. Oetjen, Y. Hernandez-Cordero, D. Trede, P. Maaß, R. Casadonte, J. Kriegsmann, A. Warth, H. Dienemann, W. Weichert, M. Kriegsmann.
    A new classification method for MALDI imaging mass spectrometry data acquired on formalin-fixed paraffin-embedded tissue samples.
    BBA - Proteins and Proteomics, , 2016.

    DOI: 10.1016/j.bbapap.2016.11.003

  5. T. Boskamp, D. Lachmund, J. Oetjen, Y. Hernandez-Cordero, J. Behrmann, J. H. Kobarg, R. Casadonte, J. Kriegsmann, P. Maaß.
    Visualizing MALDI TOF datasets of FFPE tissue samples for the purpose of quality assessment and comparison.
    OurCon IV - 2016, 17.10.-21.10.2016, Ustron, Polen.

    online unter: http://www.bioradint.eu/ourcon_public/papersview.php?showdetail=&paper_id=45