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Zentrum für Technomathematik

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Delf Lachmund

Ehemaliger Mitarbeiter der AG Technomathematik


Forschungsgebiete

Projekte

  1. BMBF-MPI²: Modellbasierte Parameteridentifikation in Magnetic Particle Imaging (01.12.2016 - 30.11.2019)
  2. Magnetic Particle Imaging (seit 01.03.2016)
  3. BMBF-MaDiPath: Massenspektrometrisches Profiling/Grading für onkologische Routineanwendungen der digitalen Pathologie (01.10.2015 - 30.09.2018)
  4. Qualitätsbewertung von MALDI-Imaging-Daten (seit 01.04.2015)
  5. Nicht-negative Matrix-Faktorisierung mit A-priori-Wissen (seit 01.12.2014)
  6. Entwicklung eines Digital-Staining-Verfahrens als pathologisch-histologisches Diagnosewerkzeug auf Basis der MALDI-Imaging-Technologie (01.07.2014 - 30.06.2016)

Veranstaltungen (Auswahl)vollständige Liste

  1. Übungen Numerik 1 (Wintersemester 2014/2015)

Abschlussarbeiten (Auswahl)vollständige Liste

  1. Klassifizierung von MALDI-Daten mit linearer Regression (Norbert Maager)
  2. Klassifikation auf MALDI-Daten mit nichtnegativer Matrixfaktorisierung und überwachtem Lernen (Maximilian Schmidt)

Publikationen (Auswahl)vollständige Liste

  1. T. Boskamp, D. Lachmund, R. Casadonte, L. Hauberg-Lotte, J. H. Kobarg, J. Kriegsmann, P. Maaß.
    Using the chemical noise background in MALDI mass spectrometry imaging for mass alignment and calibration.
    Analytical Chemistry, 92(1):1301-1308, 2020.

    DOI: 10.1021/acs.analchem.9b04473
    online unter: https://doi.org/10.1021/acs.analchem.9b04473

  2. J. Leuschner, M. Schmidt, P. Fernsel, D. Lachmund, T. Boskamp, P. Maaß.
    Supervised Non-negative Matrix Factorization Methods for MALDI Imaging Applications.
    Bioinformatics, bty909 , 2018.

    DOI: 10.1093/bioinformatics/bty909

  3. Y. Cordero Hernandez, T. Boskamp, R. Casadonte, L. Hauberg-Lotte, J. Oetjen, D. Lachmund, A. Peter, D. Trede, K. Kriegsmann, M. Kriegsmann, J. Kriegsmann, P. Maaß.
    Targeted Feature Extraction in MALDI Mass Spectrometry Imaging to Discriminate Proteomic Profiles of Breast and Ovarian Cancer.
    Proteomics - Clinical Applications, 1700168 , Wiley, 2018.

    DOI: 10.1002/prca.201700168

  4. J. Oetjen, D. Lachmund, A. Palmer, F. Alexandrov, M. Becker, T. Boskamp, P. Maaß.
    An approach to optimize sample preparation for MALDI imaging MS of FFPE sections using fractional factorial design of experiments.
    Analytical and Bioanalytical Chemistry, 408(24):6729-40, 2016.

    DOI: 10.1007/s00216-016-9793-4

  5. T. Boskamp, D. Lachmund, J. Oetjen, Y. Hernandez-Cordero, D. Trede, P. Maaß, R. Casadonte, J. Kriegsmann, A. Warth, H. Dienemann, W. Weichert, M. Kriegsmann.
    A new classification method for MALDI imaging mass spectrometry data acquired on formalin-fixed paraffin-embedded tissue samples.
    BBA - Proteins and Proteomics, , 2016.

    DOI: 10.1016/j.bbapap.2016.11.003