Logo Uni Bremen

Zentrum für Technomathematik

ZeTeM > About ZeTeM > Staff > Dr. Fedor Alexandrov

Contact Sitemap Impressum [ English | Deutsch ]
Bild Dr. Fedor Alexandrov

Dr. Fedor Alexandrov

Ehemaliger Mitarbeiter der WG Industrial Mathematics


Research Areas

Projects

  1. BMBF-MALDI AMK: 3D-MALDI-Imaging zur Analyse proteomischer Marker und klinischer Wirkstofffverteilung (01.04.2011 - 31.07.2014)
  2. Identification of the ethanol concentration out of impedance data (01.01.2009 - 30.04.2009)
  3. Development of statistical methods for classification of combustion engines (01.09.2008 - 31.05.2009)
  4. BMBF-INVERS: Dekonvolution vs. Shrinkage: Mathematische Methoden für eine verbesserte Peakdetektion (01.10.2007 - 30.06.2010)
  5. Biomarker discovery in MALDI-TOF mass spectrometry with discrete wavelet transformation (15.02.2007 - 31.03.2010)

Leader of Projects

  1. BMBF-INVERS: Dekonvolution vs. Shrinkage: Mathematische Methoden für eine verbesserte Peakdetektion (01.10.2007 - 30.06.2010)
  2. Biomarker discovery in MALDI-TOF mass spectrometry with discrete wavelet transformation (15.02.2007 - 31.03.2010)

Courses (Selection)complete list

  1. Machine Learning (Sommersemester 2013)
  2. Mathematical Methods for Analysis of Hyperspectral Images (Sommersemester 2012)
  3. Mathematical Methods in Mass Spectrometry (Sommersemester 2011)
  4. Graduiertenseminar "Scientific Computing in Engineering" (Sommersemester 2011)
  5. Classification and clustering with applications (Wintersemester 2010/2011)

Theses (Selection)complete list

  1. Morphological Image Simplification (Benjamin Niroo)
  2. Effiziente räumlich bewusste Segmentierung von MALDI imaging Datensätzen (Niels Backfisch)
  3. Nichtnegative Matrixfaktorisierung mit Kullback-Leibler-Divergenz im MALDI-Imaging (Pascal Fernsel)
  4. Structure Detection in Imaging Mass Spectrometry Data (Andreas Bartels)
  5. Kernel-based semi-supervised learning (Nicolas Schilling)

Patents

  1. P. Maaß, J. H. Kobarg, F. Alexandrov, P. Vandergheynst, M. Goldabaee.
    Verfahren zum rechnergestützten Verarbeiten von räumlich aufgelösten Hyperspektraldaten, insbesondere von Massenspektrometriedaten.
    German Patent and Trade Mark Office DE102013207402A1,
    Number of registration: 1020132074, Date of registration: 24.04.2013.
    Published in patent bulletin no.: on 30.10.2014.
  2. P. Maaß, J. Oetjen, L. Hauberg-Lotte, F. Alexandrov, D. Trede.
    Verfahren zur rechnergestützten Analyse eines oder mehrerer Gewebeschnitte des menschlichen oder tierischen Körpers.
    German Patent and Trade Mark Office DE102014224916A1,
    Number of registration: 1020142249, Date of registration: 04.12.2014.
    Published in patent bulletin no.: on 06.09.2016.
    US Patent & Trademark Office, US 20160163523 A1,
    Anmeldenummer: 14/959967 , Anmeldedatum: 04.12.2014.
    Veröffentlicht am 09.06.2016
    Intellectual Property Office, GB 2535586,
    Anmeldenummer: GB1521058.6, Anmeldedatum: 30.11.2015.
    Veröffentlicht am 24.08.2016
    Institut national de la propriété industrielle, FR 3029671 A1,
    Anmeldenummer: FR1561774, Anmeldedatum: 03.12.2015.
    Veröffentlicht am 10.06.2016
  3. D. Trede, P. Maaß, F. Alexandrov.
    Verfahren und Vorrichtung zur rechnergestützten Verarbeitung eines digitalisierten Bildes sowie maschinenlesbarer Datenträger.
    German Patent and Trade Mark Office 10 2011 003 242.8,
    Number of registration: 102011003, Date of registration: 27.01.2011.
    Published in patent bulletin no.: on 02.08.2012.
  4. F. Alexandrov.
    Determination of types of tissues with imaging mass spectrometry.
    German Patent and Trade Mark Office,
    Number of registration: 20100225.
    Zur Veröffentlichung eingereicht.

Publications (Selection)complete list

  1. J. Oetjen, D. Lachmund, A. Palmer, F. Alexandrov, M. Becker, T. Boskamp, P. Maaß.
    An approach to optimize sample preparation for MALDI imaging MS of FFPE sections using fractional factorial design of experiments.
    Analytical and Bioanalytical Chemistry, 408(24):6729-40, 2016.

    DOI: 10.1007/s00216-016-9793-4

  2. F. Hoffmann, J. M. Lotz, J. Lotz, S. Heldmann, D. Trede, J. Oetjen, M. Becker, G. Ernst, P. Maaß, F. Alexandrov, O. Guntinas-Lichius, H. Thiele, F. von Eggeling.
    Integration of 3D multimodal imaging data of a head and neck cancer and advanced feature recognition.
    BBA - Proteins and Proteomics, , 2016.

    DOI: 10.1016/j.bbapap.2016.08.018

  3. J. Oetjen, K. Veselkov, J. Watrous, J. McKenzie, M. Becker, L. Hauberg-Lotte, J. H. Kobarg, A. K. Mróz, N. Strittmatter, F. Hoffmann, D. Trede, A. Palmer, S. Schiffler, K. Steinhorst, M. Aichler, R. Goldin, O. Guntinas-Lichius, F. von Eggeling, H. Thiele, K. Mädler, A. Walch, P. Maaß, P. C. Dorrestein, Z. Takats, F. Alexandrov.
    Benchmark datasets for 3D MALDI- and DESI-imaging mass spectrometry.
    GigaScience, 4, 2015.

    DOI: 10.1186/s13742-015-0059-4

  4. C. Song, M. Mazzola, X. Cheng, J. Oetjen, F. Alexandrov, P. C. Dorrestein, J. Watrous, M. van der Voort, J. M. Raaijmakers.
    Molecular and chemical dialogues in bacteria-protozoa interactions.
    Scientific Reports, Article ID 12837 5, 2015.

    DOI: 10.1038/srep12837

  5. G. Ernst, O. Guntinas-Lichius, L. Hauberg-Lotte, D. Trede, M. Becker, F. Alexandrov, F. von Eggeling.
    Histomolecular interpretation of pleomorphic adenomas of the salivary gland by matrix-assisted laser desorption ionization imaging and spatial segmentation.
    Head & Neck, 37(7), 2014.

    DOI: 10.1002/hed.23713