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Bild Dr. Dennis Trede

Dr. Dennis Trede

Ehemaliger Mitarbeiter der AG Technomathematik

Raum: BITZ
E-Mail:  contact@scils.de

Forschungsgebiete

Projekte

BMBF-MALDI AMK: 3D-MALDI-Imaging zur Analyse proteomischer Marker und klinischer Wirkstofffverteilung 01.04.2011 - 31.07.2014
Räumlich dreidimensional aufgelöste Stoffwechsel-Analyse für die Medizin 01.07.2010 - 30.06.2012
Ermittlung des unbekannten Ethanolgehalts einer Kraftstoff-Ethanolmischung 01.01.2009 - 30.04.2009
Entwicklung statistischer Methoden zur Anwendung auf Körperschalldaten von geschleppten Verbrennungsmotoren 01.09.2008 - 31.05.2009
BMBF-INVERS: Regularisierung inverser Faltungsgleichungen in Besov-Skalen 01.10.2007 - 30.06.2010
Parameteroptimierung für die High-Content-Analyse 01.12.2005 - 30.09.2007

Leitung von Projekten

Verfahrweg-Optimierung von Spotting-Prozessen 01.11.2010 - 31.10.2011

Veranstaltungen (Auswahl)vollständige Liste

  1. Mathematische Methoden der Bild- und Signalverarbeitung (Sommersemester 2013)
  2. Mathematik in der Berufspraxis (Wintersemester 2012/2013)
  3. Weiterführende Methoden der mathematischen Bildverarbeitung (Sommersemester 2011)
  4. Mathematische Methoden der Bildverarbeitung I (Wintersemester 2010/2011)

Abschlussarbeiten (Auswahl)vollständige Liste

  1. PDE-Ansätze für kantenerhaltendes Entrauschen auf 2D- und 3D-MALDI-Imaging-Daten (Tobias Maas)
  2. Methoden der Nichtnegativen Matrixfaktorisierung im MALDI-Imaging (Delf Lachmund)
  3. Blind Source Separation für MALDI-Imaging (Jens Behrmann)
  4. Klassifikation von akustischen Signalen mit Hilfe der Fourier- und Wavelet-Transformation (Ariela Pagel)
  5. Vorwissenbasierende Aktive-Konturen-Methode zur Konturextraktion und Klassifikation (Daniel Köhntopp)

Patente

  1. P. Maaß, J. Oetjen, L. Hauberg-Lotte, F. Alexandrov, D. Trede.
    Verfahren zur rechnergestützten Analyse eines oder mehrerer Gewebeschnitte des menschlichen oder tierischen Körpers.
    Deutsches Patent- und Markenamt DE102014224916A1,
    Anmeldenummer: 1020142249, Anmeldedatum: 04.12.2014.
    Veröffentlicht in Patenblatt Nr.: am 06.09.2016.
    US Patent & Trademark Office, US 20160163523 A1,
    Anmeldenummer: 14/959967 , Anmeldedatum: 04.12.2014.
    Veröffentlicht am 09.06.2016
    Intellectual Property Office, GB 2535586,
    Anmeldenummer: GB1521058.6, Anmeldedatum: 30.11.2015.
    Veröffentlicht am 24.08.2016
    Institut national de la propriété industrielle, FR 3029671 A1,
    Anmeldenummer: FR1561774, Anmeldedatum: 03.12.2015.
    Veröffentlicht am 10.06.2016
  2. D. Trede, P. Maaß, H. Preckel.
    Method for analysing the effect of a test substance on biological and/or biochemical samples.
    US Patent and Trademark Office US2011/0098198 A1,
    Anmeldenummer: 2011009819, Anmeldedatum: 29.04.2009.
    Veröffentlicht in Patenblatt Nr.: PCT/EP09/55187 am 28.04.2011.
  3. D. Trede, P. Maaß, F. Alexandrov.
    Verfahren und Vorrichtung zur rechnergestützten Verarbeitung eines digitalisierten Bildes sowie maschinenlesbarer Datenträger.
    Deutsches Patent- und Markenamt 10 2011 003 242.8,
    Anmeldenummer: 102011003, Anmeldedatum: 27.01.2011.
    Veröffentlicht in Patenblatt Nr.: am 02.08.2012.
  4. D. Trede, P. Maaß, H. Preckel.
    Verfahren zur Analyse der Wirkung einer Testsubstanz auf biologische und/oder biochemische Proben.
    Europäisches Patentamt EP2128815,
    Anmeldenummer: 8155784, Anmeldedatum: 07.05.2008.
    Veröffentlicht in Patenblatt Nr.: 2009/49 am 02.12.2009.

Publikationen (Auswahl)vollständige Liste

  1. T. Boskamp, D. Lachmund, J. Oetjen, Y. Hernandez-Cordero, D. Trede, P. Maaß, R. Casadonte, J. Kriegsmann, A. Warth, H. Dienemann, W. Weichert, M. Kriegsmann.
    A new classification method for MALDI imaging mass spectrometry data acquired on formalin-fixed paraffin-embedded tissue samples.
    BBA - Proteins and Proteomics, , 2016.

    DOI: 10.1016/j.bbapap.2016.11.003

  2. F. Hoffmann, J. M. Lotz, J. Lotz, S. Heldmann, D. Trede, J. Oetjen, M. Becker, G. Ernst, P. Maaß, F. Alexandrov, O. Guntinas-Lichius, H. Thiele, F. von Eggeling.
    Integration of 3D multimodal imaging data of a head and neck cancer and advanced feature recognition.
    BBA - Proteins and Proteomics, , 2016.

    DOI: 10.1016/j.bbapap.2016.08.018

  3. J. Oetjen, K. Veselkov, J. Watrous, J. McKenzie, M. Becker, L. Hauberg-Lotte, J. H. Kobarg, A. K. Mróz, N. Strittmatter, F. Hoffmann, D. Trede, A. Palmer, S. Schiffler, K. Steinhorst, M. Aichler, R. Goldin, O. Guntinas-Lichius, F. von Eggeling, H. Thiele, K. Mädler, A. Walch, P. Maaß, P. C. Dorrestein, Z. Takats, F. Alexandrov.
    Benchmark datasets for 3D MALDI- and DESI-imaging mass spectrometry.
    GigaScience, 4, 2015.

    DOI: 10.1186/s13742-015-0059-4

  4. O. Klein, K. Strohschein, G. Nebrich, J. Oetjen, D. Trede, H. Thiele, F. Alexandrov, P. Giavalisco, G. N. Duda, P. Roth von, S. Geissler, J. Klose, T. Winkler.
    MALDI imaging mass spectrometry: Discrimination of pathophysiological regions in traumatized skeletal muscle by characteristic peptide signatures.
    Proteomics, 14(20):2249-2260, 2014.

    DOI: 10.1002/pmic.201400088

  5. C. Bockelmann, H. Schepker, A. Dekorsy, A. Bartels, D. Trede, K. Kazimierski.
    C-Curve: A Finite Alphabet based Parameter Choice Rule for Elastic-Net in Sporadic Communication.
    IEEE Communication Letters, 18(8):1443 -- 1446, 2014.

    DOI: 10.1109/LCOMM.2014.2329487