Dr. Janina Oetjen

Projects

1. BMBF-MaDiPath: Mass spectrometric profiling and grading for oncologic routine applications in pathology (01.10.2015 - 30.09.2018)
2. Quality assessment of MALDI imaging data (since 01.04.2015)
3. Entwicklung eines Digital-Staining-Verfahrens als pathologisch-histologisches Diagnosewerkzeug auf Basis der MALDI-Imaging-Technologie (01.07.2014 - 30.06.2016)
4. MALDI Imaging Lab – Ein interdisziplinäres Gerätezentrum zur Akquise und Analyse von Daten der bildgebenden Massenspektrometrie (since 01.07.2011)
5. BMBF-MALDI AMK: 3D-MALDI-Imaging zur Analyse proteomischer Marker und klinischer Wirkstofffverteilung (01.04.2011 - 31.07.2014)

Patents

2. P. Maaß, J. Oetjen, L. Hauberg-Lotte, F. Alexandrov, D. Trede.
   Verfahren zur rechnergestützten Analyse eines oder mehrerer Gewebeschnitte des menschlichen oder tierischen Körpers.
   German Patent and Trade Mark Office DE102014224916A1,
   Number of registration: 1020142249, Date of registration: 04.12.2014.
   Published in patent bulletin no.: on 06.09.2016.
   US Patent & Trademark Office, US 20160163523 A1,
   Anmeldenummer: 14/959967 , Anmeldedatum: 04.12.2014.
   Veröffentlicht am 09.06.2016
   Intellectual Property Office, GB 2535586,
   Anmeldenummer: GB1521058.6, Anmeldedatum: 30.11.2015.
   Veröffentlicht am 24.08.2016
   Institut national de la propriété industrielle, FR 3029671 A1,
   Anmeldenummer: FR1561774, Anmeldedatum: 03.12.2015.
   Veröffentlicht am 10.06.2016

Publications (Selection)complete list

1. A. Ardestani, S. Li, K. Annamalai, B. Lupse, S. Geravandi, A. Dobrowolski, S. Yu, S. Zhu, T. D. Baguley, M. Surakattula, J. Oetjen, L. Hauberg-Lotte, R. Herranz, S. Awal, D. Altenhofen, V. Nguyen-Tran, S. Joseph, P. G. Schultz, A. K. Chatterjee, N. Rogers, M. S. Tremblay, W. Shen, K. Maedler.
   Neratinib protects pancreatic beta cells in diabetes.
   Nature Communications, 10(5015), 2019.

   DOI: 10.1038/s41467-019-12880-5.
   online at: https://doi.org/10.1038/s41467-019-12880" target="doi">015 | https://doi.org/10.1038/s41467-019-12880

2. Y. Cordero Hernandez, T. Boskamp, R. Casadonte, L. Hauberg-Lotte, J. Oetjen, D. Lachmund, A. Peter, D. Trede, K. Kriegsmann, M. Kriegsmann, J. Kriegsmann, P. Maaß.
   Targeted Feature Extraction in MALDI Mass Spectrometry Imaging to Discriminate Proteomic Profiles of Breast and Ovarian Cancer.
   Proteomics - Clinical Applications, 1700168 , Wiley, 2018.

   DOI: 10.1002/prca.201700168

3. J. Oetjen, D. Lachmund, A. Palmer, F. Alexandrov, M. Becker, T. Boskamp, P. Maaß.
   An approach to optimize sample preparation for MALDI imaging MS of FFPE sections using fractional factorial design of experiments.
   Analytical and Bioanalytical Chemistry, 408(24):6729-40, 2016.

   DOI: 10.1007/s00216-016-9793-4

4. T. Boskamp, D. Lachmund, J. Oetjen, Y. Hernandez-Cordero, J. Behrmann, J. H. Kobarg, R. Casadonte, J. Kriegsmann, P. Maaß.
   Visualizing MALDI TOF datasets of FFPE tissue samples for the purpose of quality assessment and comparison.
   OurCon IV - 2016, 17.10.-21.10.2016, Ustron, Poland.
   

   online at: http://www.bioradint.eu/ourcon_public/papersview.php?showdetail=&paper_id=45

5. T. Boskamp, D. Lachmund, J. Oetjen, Y. Hernandez-Cordero, D. Trede, P. Maaß, R. Casadonte, J. Kriegsmann, A. Warth, H. Dienemann, W. Weichert, M. Kriegsmann.
   A new classification method for MALDI imaging mass spectrometry data acquired on formalin-fixed paraffin-embedded tissue samples.
   BBA - Proteins and Proteomics, , 2016.

   DOI: 10.1016/j.bbapap.2016.11.003