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Zentrum für Industriemathematik

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Dr. Janina Oetjen

Ehemalige Mitarbeiterin der AG Technomathematik


Projekte

  1. BMBF-MaDiPath: Massenspektrometrisches Profiling/Grading für onkologische Routineanwendungen der digitalen Pathologie (01.10.2015 - 30.09.2018)
  2. Qualitätsbewertung von MALDI-Imaging-Daten (seit 01.04.2015)
  3. Entwicklung eines Digital-Staining-Verfahrens als pathologisch-histologisches Diagnosewerkzeug auf Basis der MALDI-Imaging-Technologie (01.07.2014 - 30.06.2016)
  4. MALDI Imaging Lab – Ein interdisziplinäres Gerätezentrum zur Akquise und Analyse von Daten der bildgebenden Massenspektrometrie (seit 01.07.2011)
  5. BMBF-MALDI AMK: 3D-MALDI-Imaging zur Analyse proteomischer Marker und klinischer Wirkstofffverteilung (01.04.2011 - 31.07.2014)

Patente

  1. P. Maaß, J. Oetjen, L. Hauberg-Lotte, F. Alexandrov, D. Trede.
    Verfahren zur rechnergestützten Analyse eines oder mehrerer Gewebeschnitte des menschlichen oder tierischen Körpers.
    Deutsches Patent- und Markenamt DE102014224916A1,
    Anmeldenummer: 1020142249, Anmeldedatum: 04.12.2014.
    Veröffentlicht in Patenblatt Nr.: am 06.09.2016.
    US Patent & Trademark Office, US 20160163523 A1,
    Anmeldenummer: 14/959967 , Anmeldedatum: 04.12.2014.
    Veröffentlicht am 09.06.2016
    Intellectual Property Office, GB 2535586,
    Anmeldenummer: GB1521058.6, Anmeldedatum: 30.11.2015.
    Veröffentlicht am 24.08.2016
    Institut national de la propriété industrielle, FR 3029671 A1,
    Anmeldenummer: FR1561774, Anmeldedatum: 03.12.2015.
    Veröffentlicht am 10.06.2016

Publikationen (Auswahl)vollständige Liste

  1. A. Ardestani, S. Li, K. Annamalai, B. Lupse, S. Geravandi, A. Dobrowolski, S. Yu, S. Zhu, T. D. Baguley, M. Surakattula, J. Oetjen, L. Hauberg-Lotte, R. Herranz, S. Awal, D. Altenhofen, V. Nguyen-Tran, S. Joseph, P. G. Schultz, A. K. Chatterjee, N. Rogers, M. S. Tremblay, W. Shen, K. Maedler.
    Neratinib protects pancreatic beta cells in diabetes.
    Nature Communications, 10(5015), 2019.

    DOI: 10.1038/s41467-019-12880-5.
    online unter: https://doi.org/10.1038/s41467-019-12880" target="doi">015 | https://doi.org/10.1038/s41467-019-12880

  2. Y. Cordero Hernandez, T. Boskamp, R. Casadonte, L. Hauberg-Lotte, J. Oetjen, D. Lachmund, A. Peter, D. Trede, K. Kriegsmann, M. Kriegsmann, J. Kriegsmann, P. Maaß.
    Targeted Feature Extraction in MALDI Mass Spectrometry Imaging to Discriminate Proteomic Profiles of Breast and Ovarian Cancer.
    Proteomics - Clinical Applications, 1700168 , Wiley, 2018.

    DOI: 10.1002/prca.201700168

  3. J. Oetjen, D. Lachmund, A. Palmer, F. Alexandrov, M. Becker, T. Boskamp, P. Maaß.
    An approach to optimize sample preparation for MALDI imaging MS of FFPE sections using fractional factorial design of experiments.
    Analytical and Bioanalytical Chemistry, 408(24):6729-40, 2016.

    DOI: 10.1007/s00216-016-9793-4

  4. T. Boskamp, D. Lachmund, J. Oetjen, Y. Hernandez-Cordero, J. Behrmann, J. H. Kobarg, R. Casadonte, J. Kriegsmann, P. Maaß.
    Visualizing MALDI TOF datasets of FFPE tissue samples for the purpose of quality assessment and comparison.
    OurCon IV - 2016, 17.10.-21.10.2016, Ustron, Polen.

    online unter: http://www.bioradint.eu/ourcon_public/papersview.php?showdetail=&paper_id=45

  5. T. Boskamp, D. Lachmund, J. Oetjen, Y. Hernandez-Cordero, D. Trede, P. Maaß, R. Casadonte, J. Kriegsmann, A. Warth, H. Dienemann, W. Weichert, M. Kriegsmann.
    A new classification method for MALDI imaging mass spectrometry data acquired on formalin-fixed paraffin-embedded tissue samples.
    BBA - Proteins and Proteomics, , 2016.

    DOI: 10.1016/j.bbapap.2016.11.003