Dr. Stefan Schiffler

Research Areas

• Signal and image processing
• High Performance Computing
• Imaging mass spectrometry

Projects

1. Three-dimensional metabolic analysis (01.07.2010 - 30.06.2012)
2. Identification of the ethanol concentration out of impedance data (01.01.2009 - 30.04.2009)
3. Sparsity and Compressed Sensing in Inverse Probleme (01.06.2008 - 31.05.2011)
4. BMBF-INVERS: Dekonvolution vs. Shrinkage: Mathematische Methoden für eine verbesserte Peakdetektion (01.10.2007 - 30.06.2010)
5. DFG-SPP 1114: Mathematische Methoden in der Zeitreihenanalyse und digitalen Bildverarbeitung (01.08.2001 - 31.07.2007)

Courses (Selection)complete list

1. Mathematische Methoden der Bild- und Signalverarbeitung (Sommersemester 2013)
2. Proseminar Technomathematik (Sommersemester 2012)
3. Weiterführende Methoden der mathematischen Bildverarbeitung (Sommersemester 2011)
4. Mathematische Methoden der Bildverarbeitung I (Wintersemester 2010/2011)

Theses (Selection)complete list

1. Peak Detektion durch diskrete Wavelet-Zerlegung (Jan Hochmann)
2. Nichtstationäre Gabor-Frames und ihre Anwendung in der automatischen Musikerkennung (Sirach Lotz)
3. Die verallgemeinerte Totalvariation zur Rauschreduktion in Bildern (Stefan Loock)
4. TV-Denoising - Kantenerhaltendes Glätten von Farbbildern (Evelyn Voß)
5. Sparsity in Geosciences: Sparse Decomposition for Analysis of Sea-Floor-Pressure Data (Matthias Ehrhardt)

Publications (Selection)complete list

1. J. Oetjen, K. Veselkov, J. Watrous, J. McKenzie, M. Becker, L. Hauberg-Lotte, J. H. Kobarg, A. K. Mróz, N. Strittmatter, F. Hoffmann, D. Trede, A. Palmer, S. Schiffler, K. Steinhorst, M. Aichler, R. Goldin, O. Guntinas-Lichius, F. von Eggeling, H. Thiele, K. Mädler, A. Walch, P. Maaß, P. C. Dorrestein, Z. Takats, F. Alexandrov.
   Benchmark datasets for 3D MALDI- and DESI-imaging mass spectrometry.
   GigaScience, 4, 2015.

   DOI: 10.1186/s13742-015-0059-4

2. J. Oetjen, M. Aichler, D. Trede, J. Strehlow, J. Berger, S. Heldmann, M. Becker, M. Gottschalk, J. H. Kobarg, S. Wirtz, S. Schiffler, H. Thiele, A. Walch, P. Maaß, F. Alexandrov.
   MRI-compatible pipeline for three-dimensional MALDI imaging mass spectrometry using PAXgene fixation .
   Journal of Proteomics, 90:52-60, 2013.

   DOI: 10.1016/j.jprot.2013.03.013

3. M. Ehrhardt, H. Villinger, S. Schiffler.
   New Tools for Decomposition of Sea Floor Pressure Data.
   Computers & Geosciences, 45:4-12, Elsevier, 2012.

   DOI: 10.1016/j.cageo.2012.03.022
   online at: http://dx.doi.org/10.1016/j.cageo.2012.03.022

4. C. Brandt, P. Maaß, I. Piotrowska-Kurczewski, S. Schiffler, O. Riemer, E. Brinksmeier.
   Mathematical methods for optimizing high precision cutting operations.
   International Journal of Nanomanufacturing, 8(4):306-325, 2012.

   DOI: 10.1504/IJNM.2012.048580

5. D. Trede, S. Schiffler, M. Becker, S. Wirtz, K. Steinhorst, J. Strehlow, M. Aichler, J. H. Kobarg, J. Oetjen, A. Dyatlov, S. Heldmann, A. Walch, H. Thiele, P. Maaß, F. Alexandrov.
   Exploring Three-Dimensional Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization Imaging Mass Spectrometry Data: Three-Dimensional Spatial Segmentation of Mouse Kidney.
   Analytical Chemistry, 84(14):6079-6087, 2012.

   DOI: 10.1021/ac300673y