Delf Lachmund

Forschungsgebiete

• Signal- und Bildverarbeitung
• Numerik
• Imaging mass spectrometry

Projekte

1. BMBF-MPI²: Modellbasierte Parameteridentifikation in Magnetic Particle Imaging (01.12.2016 - 30.11.2019)
2. Magnetic Particle Imaging (seit 01.03.2016)
3. BMBF-MaDiPath: Massenspektrometrisches Profiling/Grading für onkologische Routineanwendungen der digitalen Pathologie (01.10.2015 - 30.09.2018)
4. Qualitätsbewertung von MALDI-Imaging-Daten (seit 01.04.2015)
5. Nicht-negative Matrix-Faktorisierung mit A-priori-Wissen (seit 01.12.2014)
6. Entwicklung eines Digital-Staining-Verfahrens als pathologisch-histologisches Diagnosewerkzeug auf Basis der MALDI-Imaging-Technologie (01.07.2014 - 30.06.2016)

Veranstaltungen (Auswahl)vollständige Liste

1. Übungen Numerik 1 (Wintersemester 2014/2015)

Abschlussarbeiten (Auswahl)vollständige Liste

1. Klassifizierung von MALDI-Daten mit linearer Regression (Norbert Maager)
2. Klassifikation auf MALDI-Daten mit nichtnegativer Matrixfaktorisierung und überwachtem Lernen (Maximilian Schmidt)

Publikationen (Auswahl)vollständige Liste

1. T. Boskamp, D. Lachmund, R. Casadonte, L. Hauberg-Lotte, J. H. Kobarg, J. Kriegsmann, P. Maaß.
   Using the chemical noise background in MALDI mass spectrometry imaging for mass alignment and calibration.
   Analytical Chemistry, 92(1):1301-1308, 2020.

   DOI: 10.1021/acs.analchem.9b04473
   online unter: https://doi.org/10.1021/acs.analchem.9b04473

2. J. Leuschner, M. Schmidt, P. Fernsel, D. Lachmund, T. Boskamp, P. Maaß.
   Supervised Non-negative Matrix Factorization Methods for MALDI Imaging Applications.
   Bioinformatics, bty909 , 2018.

   DOI: 10.1093/bioinformatics/bty909

3. Y. Cordero Hernandez, T. Boskamp, R. Casadonte, L. Hauberg-Lotte, J. Oetjen, D. Lachmund, A. Peter, D. Trede, K. Kriegsmann, M. Kriegsmann, J. Kriegsmann, P. Maaß.
   Targeted Feature Extraction in MALDI Mass Spectrometry Imaging to Discriminate Proteomic Profiles of Breast and Ovarian Cancer.
   Proteomics - Clinical Applications, 1700168 , Wiley, 2018.

   DOI: 10.1002/prca.201700168

4. T. Boskamp, D. Lachmund, J. Oetjen, Y. Hernandez-Cordero, J. Behrmann, J. H. Kobarg, R. Casadonte, J. Kriegsmann, P. Maaß.
   Visualizing MALDI TOF datasets of FFPE tissue samples for the purpose of quality assessment and comparison.
   OurCon IV - 2016, 17.10.-21.10.2016, Ustron, Polen.
   

   online unter: http://www.bioradint.eu/ourcon_public/papersview.php?showdetail=&paper_id=45

5. J. Oetjen, D. Lachmund, A. Palmer, F. Alexandrov, M. Becker, T. Boskamp, P. Maaß.
   An approach to optimize sample preparation for MALDI imaging MS of FFPE sections using fractional factorial design of experiments.
   Analytical and Bioanalytical Chemistry, 408(24):6729-40, 2016.

   DOI: 10.1007/s00216-016-9793-4